陽泉市熱啟動Taq酶應(yīng)用領(lǐng)域
發(fā)布時間：2024-05-09 01:14:33
陽泉市熱啟動Taq酶應(yīng)用領(lǐng)域
大部分分子診斷實驗室的核心技術(shù)都主要集中在檢測特異性、相對較短的DNA或RNA片段上。該技術(shù)能診斷傳染性疾病、鑒別影響藥物代謝的特殊基因變異型或檢測與疾病有關(guān)的基因，如與癌癥有關(guān)的基因。這些檢測的核心是實時定量聚合酶鏈反應(yīng)（PCR）、轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)擴增（TMA）、靶向擴增和信號擴增等類似技術(shù)的應(yīng)用。桑格排序和DNA片段分析或采用毛細(xì)電泳法的凝膠法都是分子診斷實驗室的關(guān)鍵技術(shù)，但他們通常還包括檢測過程中的擴增步驟。為了能順利應(yīng)用那些采用DNA和RNA來診斷疾病的檢測，分子診斷實驗室須要使用定義明確的工作流程，從而得到穩(wěn)定的、有效的結(jié)果，而當(dāng)前已存在能幫助診斷實驗室實現(xiàn)每個工作流程流水化的特殊工具。
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分子診斷的主要技術(shù)有核酸分子雜交、聚合酶鏈反應(yīng)和生物芯片技術(shù)。1.核酸分子雜交技術(shù) 具有一定互補序列和核苷酸單鏈在液相或固相中按堿基互補配對原則締合成異質(zhì)雙鏈的過程，稱為核酸分子雜交。雜交的雙方是待測核酸序列和探針序列。應(yīng)用該技術(shù)可對特定DNA或RNA序列進行定性或定量檢測。2.聚合酶鏈反應(yīng)（即Polymerase chain reaction，PCR）原理：PCR是模板DNA，引物和四種脫氧核糖核昔三磷酸（dNTP）在DNA聚合酶作用下發(fā)生酶促聚合反應(yīng)，擴增出所需目的DNA。包括三個基本步驟：雙鏈DNA模板加熱變性成單鏈（變性）；在低溫下引物與單鏈DNA互補配對（退火）；在適宜溫度下TapDNA聚合酶催化引物沿著模板DNA延伸。3.生物芯片技術(shù)是近年發(fā)展起來的分子生物學(xué)與微電子技術(shù)相結(jié)合的核酸分析檢測技術(shù)。起初的生物芯片技術(shù)主要目標(biāo)是用于DNA序列測定、基因表達譜鑒定和基因突變體檢測和分析，所以又稱為DNA芯片或基因芯片技術(shù)。由于這一技術(shù)已擴展至免疫反應(yīng)、受體結(jié)合等非核酸領(lǐng)域，出現(xiàn)了蛋白質(zhì)芯片、免疫芯片、細(xì)胞芯片、組織芯片等，所以改稱生物芯片技術(shù)更符合發(fā)展趨勢。
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熱啟動酶是耐高溫的依賴于DNA模板的DNA聚合酶，來源于嗜熱的嗜熱水生菌Thermus aquaticus YT一1，一般應(yīng)用于PCR反應(yīng)。TaqDNA聚合酶是一種M92+依賴酶，反應(yīng)體系中須有Mg2+存在，然而保持適當(dāng)?shù)腗g2+濃度十分重要，因為Mg2+濃度過高或過低均會影響引物與模板的結(jié)合、模板與PCR產(chǎn)物的解鏈溫度、引物二聚體的形成以及酶的活性與精 確性。
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Taq酶的酶動力與擴增效率有關(guān)。一般熱啟動Taq酶的酶動力越強，PCR擴增的指數(shù)增長期越長，‘S型’曲線更加典型，熒光信號值更高，而且更適合做多重PCR檢測。我們曾比較過多家公司的熱啟動Taq酶，在國外品牌中，英國Bioline公司的熱啟動Taq酶，酶動力較好，可做4重PCR，等量起始模板CT30時的熒光信號值高。在國內(nèi)品牌中，BIOG熱啟動Taq酶的指數(shù)期較長，可做3重PCR，且擴增曲線的‘S’型不受影響，其它的國產(chǎn)品牌一般只能支持2重反應(yīng)，在做3重反應(yīng)時，擴增曲線低矮，熒光信號值較低，無典型擴增曲線，結(jié)果很難判定。
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常規(guī)普通PCR常見問題：1. 優(yōu)化反應(yīng)條件，梯度摸索退火溫度，延長退火延伸時間，增加反應(yīng)循環(huán)數(shù)（30-45區(qū)間為宜）。2. 對核酸模板進行純化，或使用商業(yè)化核酸提取試劑盒進行提取，增加核酸模板的上樣量。3. 優(yōu)化反應(yīng)體系（預(yù)混體系除外），改變檢測體系中的Mg2+濃度及dNTPs用量，更換體系中Buffer。4. 重新設(shè)計引物，避免引物二聚體和鏈內(nèi)二級結(jié)構(gòu)，在一次稀釋引物后可分裝成多支小管，減少反復(fù)凍融次數(shù)。