北京實時熒光定量PCR儀應(yīng)用
發(fā)布時間:2025-01-11 01:00:33
北京實時熒光定量PCR儀應(yīng)用
大部分分子診斷實驗室的核心技術(shù)都主要集中在檢測特異性、相對較短的DNA或RNA片段上。該技術(shù)能診斷傳染性疾病、鑒別影響藥物代謝的特殊基因變異型或檢測與疾病有關(guān)的基因,如與癌癥有關(guān)的基因。這些檢測的核心是實時定量聚合酶鏈反應(yīng)(PCR)、轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)擴增(TMA)、靶向擴增和信號擴增等類似技術(shù)的應(yīng)用。桑格排序和DNA片段分析或采用毛細電泳法的凝膠法都是分子診斷實驗室的關(guān)鍵技術(shù),但他們通常還包括檢測過程中的擴增步驟。為了能順利應(yīng)用那些采用DNA和RNA來診斷疾病的檢測,分子診斷實驗室須要使用定義明確的工作流程,從而得到穩(wěn)定的、有效的結(jié)果,而當(dāng)前已存在能幫助診斷實驗室實現(xiàn)每個工作流程流水化的特殊工具。

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熱啟動Taq酶的產(chǎn)生:在PCR的反應(yīng)過程中,主要有三個階段:變性、復(fù)性、延伸。Taq DNA聚合酶的復(fù)性溫度是72℃,但其在低溫下也有活性(活性較弱),也能催化引物與模板復(fù)性,只是錯配率高,發(fā)生非特異性復(fù)性機率大。這樣在未達到72℃之前,反應(yīng)在Taq酶聚合下不斷擴增出非特異性產(chǎn)物,而使實驗失敗。在傳統(tǒng)的PCR反應(yīng)中,這樣由低溫上升至高溫的過程中,引物錯配和二聚體的形成機率非常高,Hot Start Taq DNA聚合酶就是讓PCR反應(yīng)一開始就在大于70℃下進行。當(dāng)溫度較低時,酶活性被封閉,當(dāng)溫度大于一定溫度時酶又開始工作。這樣就避免了在低溫下復(fù)性、延伸的過程,消除引物錯配和二聚體形成,減少非特異性產(chǎn)物的產(chǎn)生。我們是如何對Hotstart Taq酶修飾而讓它只在高溫下才能發(fā)揮活性?這就是Hot Start taq酶的作用原理。

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加強技術(shù)指導(dǎo)。中國動物疫病預(yù)防控制中 心要制定國家動物疫病強制免疫技術(shù)指南,組織開展省級免疫技術(shù)師資培訓(xùn)。國家獸醫(yī)參考實驗室、專業(yè)實驗室、區(qū)域?qū)嶒炇液透魇》輨游镆卟☆A(yù)防控制中 心要持續(xù)跟蹤病原變化和流行趨勢,為各地免疫方案的制定、疫苗的選擇和更新提供技術(shù)支撐。各省份要組織做好鄉(xiāng)鎮(zhèn)動物防疫機構(gòu)、村級防疫員及社會化服務(wù)組織的免疫技術(shù)培訓(xùn)。疫苗及診斷試劑供應(yīng)企業(yè)要做好培訓(xùn)、技術(shù)服務(wù)等工作。

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常規(guī)普通PCR常見問題:1. 優(yōu)化反應(yīng)條件,梯度摸索退火溫度,延長退火延伸時間,增加反應(yīng)循環(huán)數(shù)(30-45區(qū)間為宜)。2. 對核酸模板進行純化,或使用商業(yè)化核酸提取試劑盒進行提取,增加核酸模板的上樣量。3. 優(yōu)化反應(yīng)體系(預(yù)混體系除外),改變檢測體系中的Mg2+濃度及dNTPs用量,更換體系中Buffer。4. 重新設(shè)計引物,避免引物二聚體和鏈內(nèi)二級結(jié)構(gòu),在一次稀釋引物后可分裝成多支小管,減少反復(fù)凍融次數(shù)。

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選擇靈敏度高的熱啟動Taq酶。一般說,Taq酶的擴增效率高,靈敏度就高,但也有不一致的情況。如果要擴增的樣本目標(biāo)基因豐度較低,建議對Taq酶的擴增靈敏度進行檢測。常見的檢測方法是將目標(biāo)基因質(zhì)粒片段進行10倍或5倍梯度稀釋,在較低的幾個稀釋度進行PCR檢測,選擇檢測靈敏度較高的熱啟動Taq酶。目前國內(nèi)市場上常用的ABI、Bioline、Biog的擴增靈敏度都比較高,但知名品牌T的靈敏度略低,研究者可根據(jù)自身的實驗要求進行選擇。

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PCR產(chǎn)品占據(jù)分子診斷的主要市場,基因芯片是分子診斷市場發(fā)展的主要趨勢。PCR產(chǎn)品靈敏度高、特異性強、診斷窗口期短,可進行定性、定量檢測,可廣泛用于肝炎、性病、肺感染性疾病、優(yōu)生優(yōu)育、遺傳病基因、腫瘤等,填補了早期免疫檢測窗口期的檢測空白,為早期診斷、早期治療、安 全用血提供了有效的幫助。基因芯片是分子生物學(xué)、微電子、計算機等多學(xué)科結(jié)合的結(jié)晶,綜合了多種現(xiàn)代高精尖技術(shù),被專家譽為診斷行業(yè)產(chǎn)品。但其成本高、開發(fā)難度大,產(chǎn)品種類很少,只用于科研和藥物篩選等用途。