溫州市實(shí)時熒光定量PCR儀標(biāo)準(zhǔn)
發(fā)布時間:2022-06-12 01:38:11
溫州市實(shí)時熒光定量PCR儀標(biāo)準(zhǔn)
化驗(yàn)室診斷方法- -般采用的檢測依據(jù)為國家標(biāo)準(zhǔn)、農(nóng)業(yè)標(biāo)準(zhǔn),其次是有關(guān)動物疫病檢測的其它技術(shù)規(guī)程、規(guī)范等,還可以采用化驗(yàn)室自行設(shè)定的檢測方法。應(yīng)結(jié)合化驗(yàn)室條件及樣品類型等因素來選擇合適的方法。例如,化驗(yàn)室需診斷偽狂犬病,如果沒有基因擴(kuò)增儀,但有酶標(biāo)儀,就可以采用酶聯(lián)免疫吸附試驗(yàn)診斷,而不必用聚合酶鏈反應(yīng)試驗(yàn)診斷。使用化驗(yàn)室自行設(shè)定的檢驗(yàn)方法要慎重,因?yàn)?,一該檢驗(yàn)方法是否正確有待驗(yàn)證;二如果將來有爭議.上訴法院,會有較大的麻煩。

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熱啟動Taq酶產(chǎn)品優(yōu)勢;1. 靈敏度高:可直接擴(kuò)增1個拷貝的支原體DNA。2. 化學(xué)修飾,無動物性DNA污染。3. 性價比高:相對市面上zui常用的熱啟動聚合酶性價比更高。4. 擴(kuò)增效率高:熒光定量PCR起峰快,Ct值低,擴(kuò)增效率高。5. 可重復(fù)性高:熒光定量PCR擴(kuò)增曲線重合度高,受干擾影響少。熱啟動Taq酶應(yīng)用:1. 熱啟動PCR 2. 熒光定量PCR 3. DNA序列測定4. TA cloning.

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常規(guī)普通PCR常見問題:1. 優(yōu)化反應(yīng)條件,梯度摸索退火溫度,延長退火延伸時間,增加反應(yīng)循環(huán)數(shù)(30-45區(qū)間為宜)。2. 對核酸模板進(jìn)行純化,或使用商業(yè)化核酸提取試劑盒進(jìn)行提取,增加核酸模板的上樣量。3. 優(yōu)化反應(yīng)體系(預(yù)混體系除外),改變檢測體系中的Mg2+濃度及dNTPs用量,更換體系中Buffer。4. 重新設(shè)計(jì)引物,避免引物二聚體和鏈內(nèi)二級結(jié)構(gòu),在一次稀釋引物后可分裝成多支小管,減少反復(fù)凍融次數(shù)。

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在PCR反應(yīng)早期,產(chǎn)生熒光的水平不能與背景明顯地區(qū)別,而后熒光的產(chǎn)生進(jìn)入指數(shù)期、線性期和終的平臺期,因此可以在PCR反應(yīng)處于指數(shù)期的某一點(diǎn) 上來檢測PCR產(chǎn)物的量,并且由此來推斷模板初的含量。為了便于對所檢測樣本進(jìn)行比較,在real-time Q-PCR反應(yīng)的指數(shù)期,首先需設(shè)定一定熒光信號的域值,一般這個域值(threshold)是以PCR反應(yīng)的前15個循環(huán)的熒光信號作為熒光本底信號 (baseline),熒光域值的缺省設(shè)置是3~15個循環(huán)的熒光信號的標(biāo)準(zhǔn)偏差的10倍。如果檢測到熒光信號超過域值被認(rèn)為是真 正的信號,它可用于定義 樣本的域值循環(huán)數(shù)(Ct)。Ct值的含義是:每個反應(yīng)管內(nèi)的熒光信號達(dá)到設(shè)定的域值時所經(jīng)歷的循環(huán)數(shù)。研究表明,每個模板的Ct值與該模板的起始拷貝數(shù)的 對數(shù)存在線性關(guān)系,起始拷貝數(shù)越多,Ct值越小。利用已知起始拷貝數(shù)的標(biāo)準(zhǔn)品可作出標(biāo)準(zhǔn)曲線,因此只要獲得未知樣品的Ct值,即可從標(biāo)準(zhǔn)曲線上計(jì)算出該樣 品的起始拷貝數(shù)。

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熱啟動PCR(hot start PCR)是指使Taq DNA 聚合酶只有在樣品溫度至少超過70℃時才發(fā)揮作用的PCR,可提高反應(yīng)的特異性。Taq DNA 聚合酶通常在比適宜溫度低得多的條件下仍有較強(qiáng)的活性。PCR 反應(yīng)的初加熱過程中,樣品溫度上升到70℃之前,在較低的溫度下引物可能與部分單鏈模板形成非特異性結(jié)合,并在Taq DNA 聚合酶的作用下延伸。結(jié)果會導(dǎo)致非靶序列的擴(kuò)增,影響反應(yīng)的特異性。熱啟動可減少非靶序列的擴(kuò)增,提高反應(yīng)的特異性。在引物設(shè)計(jì)時如果某位點(diǎn)因?yàn)檫z傳元件的定位而受限,如site-directed 突變、表達(dá)克隆或用于DNA 工程的遺傳元件的構(gòu)建和操作等情況,熱啟動PCR 尤為有效。